《黃帝內經(jīng)》中首先提出“玄府”一詞 ，其中《素問·調經(jīng)論》有云：“上焦不通利…玄府不通，衛(wèi)氣不得泄越，故外熱。”而《靈樞·小針解篇》亦云：“玄府者，汗孔也。”由此可知人體皮膚的汗孔乃此處所說之“玄府”，關于中醫(yī)眼科的玄府理論首創(chuàng)于劉完素的《素問·玄機原病式》一書，其中專論：“論目昏赤腫翳膜皆屬熱。”說明了目病之病因病機。其論述玄府郁閉所產(chǎn)生病變的總病機時，從氣血、營衛(wèi)、津液、精神升降出入障礙的視角進行了精辟闡述：“人之眼耳鼻舌身意神識，能為用者，皆升降出入之通利也，有所閉塞則不能用也。若目無所見……悉由熱氣怫郁，玄府閉密，而致氣液、血脈、榮衛(wèi)、精神，不能升降出入故也。”這就將玄府郁閉的病理變化從無形的陽氣怫郁發(fā)展到有形的津停水阻、痰凝血瘀，涵蓋了諸多的臨床病癥，為進一步闡釋眼病玄府病機奠定了基礎。劉完素在論述目病不昧的玄府病機時曰：“熱郁于目，則無所見也。故目微昏者，至近則如蠅翼者，玄府有所閉合也。”認為目無所見或視如蠅翼皆由于玄府之閉，玄府之閉由于熱氣之郁。至此，玄府理論的目病病機補充和豐富了中醫(yī)眼科對內障眼病的認識，使眼科玄府理論初步成形。

后世明清醫(yī)家及近代醫(yī)家對玄府理論繼承發(fā)展，結合自身臨床經(jīng)驗進一步拓展了玄府理論在眼科的應用。國醫(yī)大師唐由之在其主編的《中國醫(yī)學百科全書·中醫(yī)眼科學》一書中對玄府的定義為: 玄府即元府，眼科玄府為精、氣、血等升降出入之通路門戶，若玄府郁滯則目失滋養(yǎng)而減明，若玄府閉塞目無滋養(yǎng)而三光絕。基于玄府理論的現(xiàn)代解釋，目中玄府是廣泛存在于眼中的各種細微孔道，是眼部各類物質與信息交流的最小場所，是人體氣血精液精神上注于目的樞紐。這一理論認識無疑是極其準確的，其后一些學者基于這一理論認識，提出了目中玄府與眼部微循環(huán)、神經(jīng)軸漿流運輸、免疫功能相關的假說。

玄府理論豐富了中醫(yī)眼科內障眼病治療的基本理論，拓展了治療內障眼病的方法，促進了中醫(yī)眼科的長足發(fā)展。